Estimativa de incerteza para modelos distance sampling por bootstrap — gerar_intervalos_confianca

Conduz um bootstrap para modelos de distance sampling.

Usage

gerar_intervalos_confianca_bootstrap(
  dados,
  funcao_chave = c("hn", "hr", "unif"),
  termos_ajuste = NULL,
  truncamento = NULL,
  formula = ~1,
  funcao_sumario = c("abundancia", "densidade"),
  nboot = 100,
  nucleos = 1
)

Arguments

dados: recebe um conjunto de dados filtrados pela função filtrar_dados() e transformados pela função transformar_dados_formato_Distance().
funcao_chave: recebe uma dentre três funções utilizadas para modelar a detectabilidade da espécie: "hn" - Half-normal; "hr" - Hazard-rate; e "unif" - Uniform.
termos_ajuste: recebe um dentre n termos de ajuste: "cos" - cosseno; "herm" - Hermet polynomial; e "poly" - Polinomial simples. Quando NULL diferentes modelos são ajustados para função chave escolhida utilizando diferentes termos de ajuste. Veja Details.
truncamento: recebe uma lista contendo as distâncias de truncagem de forma numérica (ex. 20), ou como porcentagem (como um caracter, ex. 25%). Também pode ser alimentada no formato de lista, com os elementos left e right (ex. list(left = 1, right =20)) se a truncagem a esquerda for necessária. Por configuração, a distância máxima é utilizada como valor de truncagem a direita. Quando os dados estão categorizados, a truncagem a direita é o valor final da última coluna. O valor de truncagem a esquerda é zero, por configuração.
formula: a fórmula para o parâmetro de escala. Para análise CDS manter a configuração original ~ 1.
funcao_sumario: defini se o bootstrap retornará intervalos de confiança para estimativa de abunância ou de densidade.
nboot: número de bootstraps a serem conduzidos.
nucleos: número de núcleos do CPU usados para realizar a estimativa do intervalo de confiança.

Value

Retornar um vetor contendo o intervalo de confiança e um gáfico de histograma contendo a distribuição de frequências da estimativa de abundância ou de densidade e seus respectivos intervalos de confiança.

Details

Quando termo_ajuste = NULL modelos com diferente termos de ajuste serão ajustados aos dados, a depender da função chave utilizada. Para funcao_chave = "hn", são utilizados os termos de ajuste NULL (sem termos), "cos" e "herm"; para funcao_chave = "hr", são utilizados os termos de ajuste NULL (sem termos), "cos" e "poly"; e para funcao_chave = "unif", são utilizados so termos de ajuste "cos" e "poly".

Examples

if (FALSE) { # \dontrun{
gerar_intervalos_confianca_bootstrap()
} # }